князь Иванъ Даниловичъ заложилъ бысть сію церковь чудное Богоявленіе каменну въ 1342 году, и по отшествіи его, великаго князя Ивана Даниловича отъ земныхъ къ Богу, по приказу совершилъ есть сію
церковь чудное Богоявленіе во святѣй обители сей ихъ бояринъ, зовомый именемъ Протасій“.
По кончинѣ великаго князя Даніила Александровича Богоявленская обитель, при содѣйствіи сына его великаго князя Ивана Даниловича, прозваннаго „Калита“, была совершенно закончена, согласно его завѣщанія: „сія же отвсюду и всѣми православными народы видима, аки зерцало
Первымъ игуменомъ Богоявленскаго монастыря былъ преп. Стефанъ, старшій братъ великаго подвижника земли Русской, преп. Сергія.
Преподобный Стефанъ постригъ принялъ въ Хотьковскомъ Покровскомъ монастырѣ. Въ то время Хотьковскій монастырь имѣлъ два отдѣленія иночествующихъ: монаховъ и монахинь.
Богоявленскій монастырь и въ первое время своего основанія пользовался особымъ уваженіемъ не только простыхъ мірянъ, но и великихъ князей. Такъ, духовникомъ великихъ князей Симеона и Іоанна былъ игуменъ Богоявленскаго монастыря, преп. Стефанъ. И во времена отдаленныя въ этой обители процвѣ
тали благолѣпіе храмовъ и подвижническая жизнь иноковъ, что и привлекало въ обитель не мало богомольцевъ знатнаго рода.
При великомъ князѣ Иванѣ Калитѣ переселился
въ Москву изъ Чернигова, опустошеннаго монголами,