Многократно башни и кельи монастыря служили тюрьмой для лиц, неугодных царскому дому.
В 1610 г., в Смутное время, монастырь был разорен и сожжен поляками и посстановлен при Михаиле Федодоровиче. В XVII и начале XVIII в. в стенах монастыря «заплечные мастера» допрашивали и пытали заключенных.
В 1812 г. здесь были провиантские склады армии маршала Даву. Монастырь был обнесен французами валом и служил им одной из главных продовольственных баз.
В бывшей монастырской трапезной, построенной в 1685 г., собраны бытовые памятники-ансамбли: жи
вопись, керамика, шитье, ткани, рукописи конца XVI в., кольчуги, шеломы, секиры стрельцов и проч. Чрезвычайно любопытна огромная водосвятная медная рас
писная чаша, чеканенная от руки мастерами Оружейной палаты в 1685 г. _
Здесь, в музее, рядом с главным надвратным храмом: с колонками тосканского ордера показывают в кре
постной стене узкое окошечко, за решеткой которого умерла в заточении царевна Софья, сестра Петра I, стремившаяся завладеть престолом. Здесь же в монастыре была заключена и одна из невесток Ивана Грозного под именем Александры.
«Политические катастрофы, бури, народные бедствия и возмущения, борьба за власть, интриги в царской семье—все это нашло своеобразное отражение в са
мом монастыре и его летописях»,—гласит надпись при входе в монастырь.
Пройдя главные ворота, вы попадаете в монастырский двор, веками превращенный в кладбище, со старинными памятниками князьям, графам, почетным дворянам, до
блестным воинам, действительным статским советникам и проч. п